畸形精子症患者可能使配偶怀孕，但畸形精子不能使配偶怀孕。男性每次排精约排出几千万到3亿的精子，多数精子为不成熟状态，所以可能表现为各种畸形。

临床判断生育能力，主要是根据正常精子比例，依据WHO(世界卫生组织)第五版标准，正常精子达4%时可维持正常生育能力。如果畸形精子症患者正常形态精子小于4%时，会影响受孕能力，但并不影响优生优育，因为任何畸形精子都不会造成女性自然怀孕。部分精子运动能力较差时，可通过人工授精的方式使女性受孕。