小腹痛、肾痛的常见原因如下：

1、泌尿系统结石或梗阻：肾结石、输尿管结石时，若结石嵌顿在某一处，容易出现小腹痛、肾痛，甚至出现肾绞痛。部分患者可伴血尿或尿频、尿急、尿痛等尿路感染症状；

2、急性肾盂肾炎：常出现腰痛，特别是肾区叩击痛，有时会出现小腹坠痛伴发热、畏寒，甚至寒战、高热。尿检时会有尿中白细胞、红细胞增多，尿中细菌增加。血常规检查可出现血中白细胞总数增高，嗜中性粒细胞百分比明显增高。

当出现小腹痛、肾痛时，可以进行尿常规、血常规监测，同时结合影像学检测，包括腹部B超监测以及CT检查明确。