房间隔缺损典型的杂音就是在肺动脉瓣区，也就是胸骨左缘的第2-3肋间可以听到收缩期吹风样杂音，同时伴有第二心音亢进和固定分裂，少数病人还可以触及到收缩期震颤。该杂音产生可能是由于右心负荷量增大、右心排血量增多，导致相对的肺动脉瓣狭窄，并不是由于血液流过房间隔缺损处所产生。

房水平分流本身并不产生杂音，在左向右分流量比较大的情况下，可以在胸骨左缘的下方听到舒张期隆隆样杂音，这是由于三尖瓣相对性狭窄所形成。