去除黑色素瘤方法最早为手术切除，目前外科手术仍是治疗恶性黑色素瘤最主要方法。通过手术切除病变后可以即刻将缺损修复重建，除手术外，黑色素细胞对低温较敏感，低温治疗、液氮冷冻治疗对恶性黑色素瘤也存在肯定疗效，一般经过2-3次冷冻后浅表病变可以完全消失。

近几年恶性黑色素瘤治疗取得显著进步，主要是免疫治疗的加入包括大剂量干扰素治疗，免疫检测点即PD-1治疗，使治疗成功率大大增加。以往恶性黑色素瘤的5年存活率，皮肤是50%，黏膜只有20%，现在免疫治疗加入后提高了大概20%。免疫治疗相对于传统治疗存在很大发展潜力。