目前生殖器疱疹的治疗主要使用抗病毒药物，如阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦等，外用药可选择喷昔洛韦乳膏。上述药物可用于治疗生殖器疱疹、单纯疱疹，从而达到减少病毒排出，减轻症状的目的。

但需要注意，目前抗病毒治疗无法完全清除体内病毒，故生殖器疱疹可反复发作。如果疱疹发作较为频繁，如一年发作超过6次，患者应到医院接受完整治疗，即抑制性疗法，通常疗程在半年左右。另外，治疗和预防疱疹复发不能仅进行药物治疗，而是应从健康、睡眠、饮食等多方面预防，保持健康的生活方式。