子宫内膜异位症的原因目前尚不完全明确，常见有以下几种理论：

1、子宫内膜种植学说，因为子宫内膜异位症顾名思义，就是子宫内膜种植到其它地方，且进行生长，出现定期出血的症状；

2、经血逆流，比如患者有生殖道畸形、梗阻，或者是经期有性生活，都会造成经血逆流。造成内膜在其它部位进行种植，发生子宫内膜异位症；

3、手术造成子宫内膜在其它部位种植，或者经过淋巴、静脉播散，造成子宫内膜异位症；

4、子宫内膜异位症与免疫有一定关系，比如红斑狼疮患者，子宫内膜异位症的发生率比正常人高；

5、具有一定遗传因素，例如患者的一级女亲属，患子宫内膜异位症的风险相对较高。