手足口病是由肠道病毒感染引起，肠道病毒有很多种，如EV71、柯萨奇、埃可等病毒，以上病毒感染都会导致手足口病。

手足口病发病后出现发热，其持续的时间跟不同的病毒也有关系，如EV71病毒会比较严重，出现严重的情况，其发热时间会较长，柯萨奇、埃可等病毒出现重症的可能性较小，其发热时间会较短。

一般情况下普通的手足口病患儿2-3天基本上发热就能结束，但是如果出现严重的情况，如出现脑膜炎、脑炎、其他部位的损害表现时，发热的时间会延长，延长的时间跟脑炎或脑膜炎的损伤程度、持续时间有密切关系，具体时间会较长，约1-2周的时间。