肛门疣，一般是由于感染人乳头瘤病毒引起，主要通过以下两种方式传播：

1、性传播：尖锐湿疣是一种性传播疾病，尤其是同性恋，男性同性恋进行肛交的过程中，感染人乳头瘤病毒，造成肛门疣状物的新生物。病毒量比较大，肛门的黏膜可能会有所损伤，病毒容易侵袭造成感染。患者要排除性伴侣，有无不洁的性生活史，或者是否感染人乳头瘤病毒，如果有，进行性生活时，容易传染；

2、间接传播：生活中接触到人乳头瘤病毒，如马桶、酒店出差或者是其他地方有病毒，会感染造成疣。部分患者免疫力低下，如肝移植或者肾移植的患者，长期服用免疫抑制药，容易感染肛门疣。正常人机体的免疫力功能完善，接触到少量的病毒，会被清除掉。