孩子在出生后3个月需要进行体格检查，检查内容包括以下几个方面：

1、生长发育评估：需要测量身高、体重、头围，如果发现异常，需要寻找原因，尤其是疾病的影响，如甲状腺功能减退及消化性疾病等，需要给予对症治疗；

2、全身检查：孩子在3个月的时候，需要进行全身的检查，注意皮肤是否存在湿疹，注意心脏是否存在杂音，必要时做超声心动检查。另外需要注意髋关节的检查，注意是否患有先天性髋关节发育不良或髋关节脱位等，并应给予进一步的检查和治疗。此外，还要注意心、肺、腹部的详细查体；

3、血常规：孩子3个月的时候，需要注意是否伴有贫血，尤其是缺铁、缺乏维生素B₁₂和叶酸引起的营养性贫血，如果存在则需给予治疗；

4、其他检查：需要关注孩子的智力发育情况，并且检查孩子肌力、肌张力以及运动发育、神经发育的情况。