克林霉素凝胶、阿达帕林凝胶的作用机制和适应症均有所差异，并无孰优孰劣的区分。克林霉素凝胶对炎症性疾病效果较好，阿达帕林凝胶对非炎症性粉刺或局部皮肤角化异常效果较好。
克林霉素凝胶属于抗菌素外用制剂，主要成分为克林霉素，常用于革兰氏阳性菌感染的治疗，包括普通细菌性毛囊炎、炎症性痤疮。如果存在明显红肿，甚至脓尖，外用克林霉素凝胶治疗效果较佳。
阿达帕林凝胶主要成分为阿达帕林，属于维甲酸类药物，主要作用为抑制局部皮脂分泌，调节皮肤毛囊口的角化和堵塞。此药物主要用于非炎症性粉刺治疗，比如黑头粉刺、白头粉刺，具有良好的效果。阿达帕林凝胶同样具有一定抗炎作用，但效果相对较弱。
