加替沙星眼用凝胶使用方法是用在眼睛内，通常使用前先用肥皂洗手，然后用手牵拉下眼皮，让结膜囊可以暴露出来，此时下眼皮里有个凹，再用另一只手将眼药凝胶挤在下眼皮内即结膜囊里，挤完以后闭眼休息3-5分钟。

如果医生告知眼睛外侧或者眼皮上有炎症，可以在医生的指导下使用在外侧。通常眼药膏或者眼用凝胶均涂在眼睛内，需牵拉下眼皮进行涂抹，体位是向后仰或者平躺均可。