深龋补牙后有隐隐疼痛，属于常见现象。深龋是龋洞已经发展比较深，离牙髓腔较近，有牙髓症状，此时可能部分残存牙体硬组织保护髓腔，但细菌已经深入到牙神经，侵犯牙神经。医生通常采取保护牙髓的措施，使用保护牙髓的材料和垫底材料，修复龋洞。临床观察和细菌真正侵犯的程度之间，不是十分匹配、准确，细菌侵犯牙神经是慢性过程，部分医生可能认为还残存一点牙体组织，可以保留牙髓，采用深龋保护牙髓垫底充填。但是细菌可能已经侵犯到牙神经，补完龋洞后才发现隐隐作痛，是因为神经被细菌感染的炎症没有完全控制住。
临床常见处理方法是观察，如果2周后缓解说明牙神经能够恢复，如果没有缓解，仍然隐隐作痛或加重，甚至自己待着就疼，吃冷热疼，说明已经发展为牙髓炎，必须做杀神经治疗。如果基于两者之间，可以观察1-3个月，观察变化。观察期间要注意不要用深龋充填后的牙齿吃东西，不要造成冷热过度刺激。
