万古霉素是临床上级别比较高的抗感染用药，作用比较强，不良反应不明显，有几个特异性不良反应比较严重。可能会出现伪膜性肠炎及血细胞毒性，如发生再生障碍性贫血、血小板下降等，可能还会出现过敏性休克，及其他不良反应。

此药作为抗感染用药，同时也是处方药，要在医院经过医生规范诊疗后，由医生指导选用，最好是感染专科医生会诊后应用。由于抗感染作用比较明确，以上不良反应也比较明确，但是部分不良反应的发生率不明确，如伪膜性肠炎等。

在用药过程中给予密切监测，最好有药师加入，药师可以用药监护发现不良反应，或者预防不良反应发生，有助于药物应用安全。在用药过程中要注意，如果有任何不能耐受反应或者症状，应该及时和医护人员或药师沟通，以便及时给予处理和治疗。