革兰氏阴性的双球菌，指的是细菌涂片的结果。因为细菌的细胞壁结构不同，涂片结果可以显示革兰氏阴性或革兰氏阳性，革兰染色阴性表示这个双球菌是阴性菌。双球菌指的是细菌的形态，每个细菌都是1个球，2个球在一起就叫双球菌，有的时候不止2个在一起，部分球菌还有4个在一起。

临床上最为多见的就是脑膜炎双球菌，又称为脑膜炎奈瑟菌，可以引起流行性脑脊髓膜炎。流行性脑脊髓膜炎是一个传染病，通过呼吸道传播，脑脊髓膜炎代表着病变的部位是在脑子里，脑子和脊髓的膜发炎。所以一旦真的发现革兰阴性双球菌，还需要进一步鉴定明确是否为脑膜炎双球菌，临床上可能性最大的，就是容易引起流行性脑脊髓膜炎的脑膜炎双球菌。