乙肝小三阳患者有时能办健康证，有时不能。乙肝小三阳本身不会成为办健康证的阻碍，但是乙肝小三阳患者有时会出现肝脏受伤表现即肝炎表现，其在化验检测时可以看到肝脏生化指标里最为重要一条，即转氨酶高。

此时患者有肝炎活动，我国目前规定该类患者不建议或者不能办健康证。所以有乙肝小三阳患者有时能办健康证，有时不能，其取决于患者肝脏生化检测中转氨酶的高低，即肝脏有没有炎症，这是最主要的判断指标。