鼻内窥镜手术是微创手术，在内窥镜下能够很清楚的发现病变或进行手术操作，其危险分为全身情况与局部情况。术前要对病人全身进行全面检查，包括心电图、验血、彩超、CT、磁共振等，需查明病变本身范围、大小、程度。另外，对病人全身情况要进行充分了解，对有其它重病者不考虑手术。此外，手术本身存在一定风险，因部位不同，手术方法不同，损伤程度不同，出现的危险程度也不同。容易出现最重要的危险是蝶窦手术，需避免伤及到视神经和颈内动脉，此外还包括鼻顶部手术，需避免造成脑脊液鼻漏、脑膜炎。