乙肝小三阳患者，通常处于免疫耐受期，可以表现为没有任何症状。如果发展到慢性乙型肝炎阶段，就会出现临床症状，病情较轻的患者可反复出现乏力、头晕、食欲减退、厌油、肝区不适、睡眠欠佳等表现。

如果患者病情较重，会有明显或持续肝炎症状，如乏力、纳差、腹胀、尿黄，查体会发现有肝病面容、肝掌、蜘蛛痣、脾大等，化验单可以看到转氨酶持续或反复升高，表现为谷草转氨酶和谷丙转氨酶升高。如果肝功能损伤较严重，可能会伴有白蛋白和前白蛋白降低。部分患者如果发展到肝硬化阶段，甚至会出现肝功能衰竭及肝硬化相关并发症，如食管静脉曲张、腹水、肝性脑病等。