指甲壳凹凸不平，原因包括以下几个方面：

1、先天性因素：出生时指甲就凹凸不平；

2、病理因素：患者生活不规律、饮食不均匀，有甲营养不良的情况。或者有真菌感染，出现甲真菌病即甲癣，或者甲下扁平苔藓。另外银屑病会有指甲表面出现点状凹陷的特殊表现，称为甲凹点；

3、正常老化：随着年龄增长，人的各个器官都在逐渐老化，指甲也随之发生变化，可以出现光泽变淡和凹凸不平。

因此指甲出现凹凸不平，应该到正规医院的皮肤科，经皮肤科医生的详细检查，配合相关化验来明确病因，并给予正确治疗。