生殖器上长了透明水疱并且破皮，最有可能的原因就是感染了生殖器疱疹。这是一种性病，是单纯疱疹病毒导致。

大多数人是单纯疱疹病毒2型，少数人也可以由单纯疱疹病毒1型造成，表明性伴侣或者配偶可能接触过这类病毒，然后出现感染。

感染以后一般有几周的潜伏期，之后生殖器上会出现比较细腻的红斑、红疹，在此基础上很快会形成透明的水疱。水疱有时会逐渐变成脓疱，有时会直接破裂。破皮以后，会有疼痛、瘙痒的感觉，如果合并细菌感染会出现溢脓和疼痛。

大多数这种皮损即使不治疗，一般2-3周的时间也能够完全愈合。不过因为是病毒感染，没有特效的抗生素进行治疗，所以容易反复发作，特别是感染的头1年之内，会比较容易复发。

发作期间有可能会出现发热、腹股沟淋巴结肿大等症状，一般容易生长在包皮、龟头以及女性的外阴等。得了生殖器疱疹，由于该病具有传染性，应该积极诊治。