幽门螺杆菌的检测方法，临床上分为侵入性和非侵入性。侵入性大部分通过胃镜取活检，或通过快速尿素酶试验取组织检测，叫侵入性检查。

非侵入性检查包括临床上应用比较多的碳13，或碳14呼气试验，判断胃里幽门螺杆菌的存在情况。碳13和碳14是同位素，一般碳13没有任何辐射，多运用于孕妇、小儿的检测。还有部分患者对辐射非常介意，也可以选择碳13。因为相比碳14呼气试验可能价格更贵，除小儿、孕妇之外，其他人群大部分选用碳14呼气试验。

除呼气试验可以检查之外，现在体检抽血也可以检测血里幽门螺杆菌的抗体，还有大便里也可以检测抗原抗体，这些都是非侵入性检查。