大部分肾囊肿性病变通常不能通过药物得到缓解或者治愈，大部分肾脏囊肿性病变没有明确病因。只有极少数囊肿与遗传有关，比如某些基因突变。囊肿性病变多具有多发性，肾脏具有多发性囊肿的病变可称为多囊肾。

大多数肾脏囊肿与多囊肾不同，病因不明确。小的肾囊肿不需要特别治疗，通常观察即可。较大的囊肿或者引起肾积水、高血压等症状的肾囊肿可以通过手术治疗。药物对于囊肿治疗通常没有明确疗效，可能会在某些特定的囊肿方面，比如多囊肾时可考虑使用药物，减缓囊肿发展的速度，但是大部分肾囊肿不考虑使用药物缓解。