脊柱关节炎属于慢性的自身免疫病，所以很多的患者要长期服用药物。最常见的药物的副作用首先是胃肠道反应，如果长期服用止疼药，包括免疫抑制剂，都会出现胃肠道的反应，甚至严重者会出现胃溃疡，甚至胃出血。所以主要副作用有：
1、胃肠道的反应；
2、肝肾毒性：一般服用这种药物的患者，建议一定要定期检测肝肾功能。如果发现肝肾功能有轻度异常的表现，指导患者进行适当减量，或者减停，减少副作用。如果出现肝功能异常比较严重，会停药，甚至换药。
因为这类型疾病需要长期服用，如果病情稳定，将药物控制在最小范围，将副作用降到最低程度。