根据WHO第五版，正常形态精子百分率的正常值为4%，因此正常形态精子百分率为3%属于异常，临床可诊断为畸形精子症。部分医院可能目前仍在采用WHO第四版，由于检测方法不同，其正常形态精子百分率为15%，13%则提示畸形精子症相对更严重。

正常精子形态百分率3%，实际并不影响受孕能力，可以达到正常人群的75%。因为怀孕受多种因素影响，包括女方因素等，所以仍可尝试正常备孕。畸形精子症并不等同于胎儿畸形，畸形精子症仅影响怀孕，由于受精卵是由正常精子与卵子结合形成，畸形精子无法受孕，因此通常不会影响胎儿质量。