在应用化疗药物的时候有共性的不良反应，比如骨髓抑制，化疗药物对增殖比较旺盛的组织即骨髓会产生明显的影响，引起骨髓的抑制，造成白细胞、红细胞、血小板的降低。对于胃肠黏膜的影响，造成胃部不适、食欲下降、恶心、呕吐、进食不好等影响，严重者可以引起水电解质的紊乱。这些药物在代谢过程当中会对相关的脏器产生损害，比如通过肝脏、肾脏代谢的时候产生肝脏、肾脏的毒性。长期应用化疗的时候会造成机体的免疫力下降，影响后续的治疗。
淋巴癌常用的治疗方案也有不良反应，比如治疗霍奇金淋巴瘤常用MOPP方案，毒性作用主要体现在对生殖功能的损伤和诱发第二原发肿瘤的增加，尤其是对孩子。ABCD方案主要是对心脏和肺脏的毒性作用，治疗非霍奇金淋巴瘤时比如按照CHOP方案，不良反应还是消化道或者是呼吸系统症状，如呼吸困难，胸闷，包括心律失常、过敏、血尿等。通过积极的治疗、护理，大多数患者的不良反应能够得到明显的缓解。