益生菌是目前在市面上常见的口服活菌制剂，由双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌、枯草芽孢杆菌等活菌组成。

活菌制剂在临床上用于腹泻、便秘、腹胀、消化不良等消化系统疾病患者。很多患者的慢性消化系统疾病，比如慢性腹泻、习惯性便秘，和肠道菌群紊乱有关，通过活菌制剂能够改善和调节肠道菌群，可以对消化系统疾病进行治疗。

同时，研究发现部分慢性疾病患者，比如高血压、高脂血症、糖尿病等患者的体内肠道菌群也存在一定程度的紊乱情况，也可在医生的指导下，进行补充菌群治疗。