脊髓室管膜瘤通常是一种偏良性的肿瘤，偶尔有恶性程度相对高一些的III级脊髓室管膜瘤。中枢神经系统肿瘤按照恶性程度分级，可以分为I级-IV级。I级是一种良性肿瘤，II级和III级属于过渡的低度恶性和中度恶性肿瘤，IV级属于恶性程度最高的肿瘤。大部分的脊髓室管膜瘤属于II级肿瘤，即属于低度恶性或者偏良性的肿瘤，和I级的完全良性肿瘤不太一样。

大部分的脊髓室管膜瘤与正常脊髓有一定的边界，富有经验的神经外科医生可以实现肿瘤全切，并且切除之后患者的神经功能障碍有望得到比较理想的恢复。由于脊髓室管膜瘤属于II级，在手术切除之后仍然需要进行，定期的神经系统影像学复查和临床随访，如果发现肿瘤复发则需要考虑再次手术。

也有少数的脊髓室管膜瘤，属于间变性的室管膜瘤，该室管膜瘤属于恶性的。因为间变性的室管膜瘤属于III级肿瘤，所以就属于恶性程度相对较高的肿瘤。