泌尿系统反复感染多数是因为治疗不彻底，以及细菌或其他病原体毒力过强，也存在泌尿系统梗阻等原因。泌尿系统感染主要是细菌或非细菌性病原体感染，如大肠埃希菌、链球菌、金黄色葡萄球菌、支原体、衣原体等，从尿道口进入尿道、膀胱等部位，形成局部的菌落堆积。部分甚至通过输尿管上行至肾脏肾盂，而产生急性的肾盂肾炎，或慢性泌尿系统感染。

通常需使用广谱、药敏试验敏感的药物进行相应处理，且需足剂量、足疗程使用。通常包括头孢二代、头孢三代，以及喹诺酮类等药物，连续治疗1-2周，在复查尿常规或尿培养后，确定没有明确感染征象时即可停药。另外局部卫生不洁、饮水量过少、不洁的性生活等，也可能造成泌尿系统感染反复发作。对于毒力较强的细菌，使用广谱抗生素可能效果欠佳，所以需使用药敏试验的相关药物，进行足剂量、足疗程治疗。