自身免疫性肝炎，因为目前病因不明，相对诊断亦是比较困难，需要病理学的诊断，就是在肝组织活检里边取1块肝组织到显微镜下，根据自身免疫性肝炎的表现进行确诊。所以相对治疗并没有特别较好的办法，严格意义来讲，并不能彻底治愈。目前临床上所使用的标准治疗是激素加上免疫抑制剂，比如硫唑嘌呤类药物。此类药对身体损伤也是比较严重，而且自身免疫性肝炎治疗是长期的过程，经过3-5年的治疗之后，又进行第2次的肝穿，发现患者肝脏的炎症已经缓解，此时才有停药的指征。
停药之后也并非是一劳永逸，需要定期进行检查，查看患者的肝功能，特别是谷丙转氨酶、谷草转氨酶的情况，如果存在波动，还需治疗。所以自身免疫性肝炎治疗是一种长期、反复的过程，需要进行第2次肝穿，需要使用激素，需要使用免疫抑制剂，而免疫抑制剂和激素的使用，只存在一种减量的过程，并不能很快就能停药，而减药到停药又是漫长的过程。
