霉菌反复发作的原因可能是有反复感染，可能家里有感染源，如卫生间或者器具长期存放不当，或者缺乏日晒、消毒可能有反复感染，或者性伴侣也有霉菌的感染，但没有明显的症状，同房以后会反复感染。

有些人感染了耐药的菌，当时的治疗可能暂时抑菌，可能表现为没有症状，称作临床治愈，但在抵抗力低的情况下又出来了，造成反复感染。尤其在月经期间，经血流出的时候会改变阴道的酸碱度，这时抵抗力会低，会造成反复感染。

也可能是在治疗的时候可能暂时把霉菌抑制住了，但是阴道的酸碱度一直不合适，正常寄生的菌，如乳酸杆菌能维持阴道酸碱度环境，而缺乏这种菌就容易反复感染，治疗上可以在不用其它药的情况下补充乳酸杆菌栓剂放在阴道里面。