吞咽口水耳朵疼的原因有三方面：

1、患者游泳、洗澡以后耳朵里进水，发生感染，鼓膜充血明显，此时患者咽口水耳朵里会产生疼痛；

2、口咽部、喉咽部存在急性炎症，反射到耳部，从而出现耳部疼痛。建议患者进行耳鼻喉专科检查，明确是否存在急性咽炎、扁桃体炎，急性会厌炎、喉炎以及咽喉部溃疡等病变；

3、患者刚坐过飞机，中耳腔里的气压在飞机起飞或下降时有明显改变，出现航空性中耳炎，也会出现咽口水耳朵痛。

综上，建议患者明确病因后积极对症处理，必要时到医院做进一步检查。