孩子小便疼的原因具体如下：

1、包皮龟头炎：孩子小便疼一般出现在天气炎热，活动量比较大，饮水比较少，排尿比较少的情况，经常是男孩子出现，可以看到包皮比较长，有包茎的情况，在包皮局部可以看到水肿、红肿、疼痛，甚至有少量分泌物，这个时候可以判断是包皮龟头炎；

2、尿路感染：如果孩子在小便的时候同时有疼痛感、尿频、尿急，可能是尿道炎，如果查尿常规可能里面的白细胞会增高，细菌计数会增多，提示尿路感染；

3、膀胱炎、急性肾盂肾炎：有的孩子在小便疼痛、尿频、尿急的同时，还可能有发热，甚至血尿的情况，这类孩子不排除有膀胱炎、急性肾盂肾炎的可能。因此要进一步查彩超，以了解膀胱、输尿管，或者肾脏情况，看是否有上尿路畸形，比如肾积水、输液管狭窄，造成的输尿管扩张、输尿管积水、肾积水，还有神经元膀胱等少见情况。

因此，如果孩子偶尔出现小便疼痛，一般是局部感染，或者尿路感染，多喝水、多排尿就没问题，如果经常出现，一定要做彩超检查，看膀胱、肾脏、输尿管的情况，如果搞不清楚，一定要专科医生做正确的正规的评估以后，再进行下一步治疗。