肾结石不同大小有不同的分级，因输尿管口径是3-6mm，所以根据这个原则对肾结石进行分级。小于3mm的肾结石往往无需要殊处理，通过自然输尿管腔即可排出。对于小于6mm结石有绝大部分病人也可排出，这时要辅助一些药物、多饮水、适当运动促进结石排出。

此外对于大于6mm结石通常需体外碎石，甚至经皮肾镜手术或输尿管软镜手术进行治疗。具体治疗有几种方式，结石若小于2cm的上级结石和中级结石可选用体外振波碎石，更大的结如大于2cm通常选用经皮肾镜或振波碎石。另外输尿管软镜碎石，对下盏结石或者输尿管结石不是特别大，1-1.5cm的结石可通过输尿管软镜进行碎石，这种方式碎石率较高、安全性较好。腹腔镜手术可把结石完整取出，也是可选的一种方式。