梅毒抗体阴性表明在检测标本中未检测到梅毒抗体。梅毒抗体具有特异性，属于梅毒感染所特有的抗体，其他疾病均不会产生梅毒特异性抗体。所以若检测到梅毒抗体阴性，通常可以排除梅毒感染。

另外，若被检测者感染梅毒螺旋体，但感染时间较短，如感染在2-4周内的情况下，免疫系统尚未及时产生梅毒抗体，此时被检测者处于窗口期，所以检测结果也可能为阴性。但若被检测者存在高危行为，且高度怀疑感染梅毒，则检查结果是阴性的情况下也应推迟数周后重复进行检测。若此时患者的梅毒抗体呈阳性，则可确诊为梅毒感染。