HPV11型阳性不一定是尖锐湿疣，但绝大部分的HPV11型阳性，尤其是外生殖器部位的HPV11型阳性，就是尖锐湿疣。HPV的临床亚型较多，有上百种的临床亚型，尖锐湿疣常见的亚型是6型、11型、16型和18型。HPV11型主要的存在部位，是尖锐湿疣的皮疹部位。
除尖锐湿疣的皮疹部位外，在其他部位，例如咽喉部位的乳头状瘤、结膜部位的乳头状瘤，也有可能会存在HPV11型阳性。所以HPV11型阳性的标本检测，其取材来源于外生殖器部位的疣状皮疹，就可明确为尖锐湿疣。如果HPV11型阳性的取材来源于咽喉部位，或者来源于结膜部位，可能是咽喉部位或者结膜部位的乳头状瘤，而不考虑尖锐湿疣。
所以HPV的取材来源不同，临床诊断不一样。尖锐湿疣是外生殖器部位的HPV感染，主要在外生殖器部位有疣体存在，同时取材证实是HPV11型阳性，这个部位的疣体是尖锐湿疣。而其他非外生殖器部位，则不能诊断为尖锐湿疣。
