在眼皮上面出现扁平疣，不仅影响美观，更可能对眼部健康构成潜在威胁，去除眼皮扁平疣的具体治疗措施如下：

1、药物治疗：可选择使用抗菌药物、维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等，这些药物有助于消除扁平疣，但需要坚持使用一段时间才能见到效果。维A酸具有光敏性，必须晚上使用，薄薄涂一层，而咪喹莫特乳膏的用药时间一般为8-12周，最多不超过16周；

2、物理治疗：对于药物治疗效果不明显的情况，也可以考虑物理治疗，比如二氧化碳激光、液氮冷冻治疗、微波治疗等，物理方法可直接作用于扁平疣，达到快速治疗的目的。但需要注意的是，这类方法可能对周围皮肤造成一定的损伤，因此治疗后需要加强护理；

3、手术治疗：对比较大的疣体，以及无法通过药物治疗或物理治疗的扁平疣，需要采取手术切除的方法。

上述为常见的治疗方法，但需要根据医生建议以及个人具体情况选择最合适的方法。一定要记住，任何医疗决策都应在专业医生的指导下进行，千万不要自行处理，以确保治疗的安全性和有效性。