肛周脓肿多久形成肛瘘，在临床上没有特别规定。有时肛周脓肿即使已经形成肛瘘，疾病的早期表现带给临床医生的印象仍为肛周脓肿。如果肛周脓肿切开引流后，愈合又反复发作，此时才提示有可能是肛瘘。

因为B超技术不断发展，目前可以通过做高频B超判断是否形成肛瘘。因为B超探头需要放入肛门中，患者会比较痛苦，部分患者可能无法接受。肛周脓肿和肛瘘可以互为转化，临床中部分患者通常是因为有腹泻症状，而造成肛瘘和肛周脓肿同时存在。因此在治疗肛周脓肿的同时，要特别注意大便是否较稀，需要对其加以控制。