肿瘤内科主要是通过化疗、靶向治疗及免疫治疗等手段治疗肿瘤，肿瘤外科主要是通过外科手术治疗及根治肿瘤。
肿瘤内科和外科的治疗方式，主要是根据患者具体的情况。若患者发现较早，属于早期能够手术切除情况下，通常建议患者在外科治疗，若患者属于晚期需要姑息性治疗，建议患者在肿瘤内科治疗。
近年来肿瘤内科和肿瘤外科具有一定的互通性，若患者的病变属于潜在可切除的情况，肿瘤外科会做新辅助的减瘤化疗帮助患者能够使肿瘤缩小，以达到肿瘤切除的目的。
因此肿瘤外科也会做些化学治疗，肿瘤内科通常也会有些介入的治疗，就目前而言，肿瘤内科和肿瘤外科没有完全的区分。
随着目前肿瘤治疗方式的增多，许多医院越来越提倡多学科诊疗的模式，在有复杂患者的情况下，会在肿瘤内科、肿瘤外科 、放疗科、影像学科及病理学科等多学科专家组成团队对患者进行综合的判断，制定最佳的治疗方式。
