血红蛋白电泳主要是针对地中海贫血疾病来进行检查，所谓地中海贫血又叫海洋性贫血，一般是遗传因素导致血红蛋白里的珠蛋白链合成异常。珠蛋白链有α、β、γ不同类型。

当基因改变以后，导致某类型珠蛋白链发生合成障碍，在做血红蛋白电泳时，会发现α、β或γ哪个类型的合成降低、缺失。

对于判断地中海贫血的类型，根据缺失多少可以决定疾病严重程度，所以血红蛋白电泳往往只是针对地中海贫血患者来进行检查。

地中海贫血患者主要在我国广东、广西、四川有比较多的发病率，在长江以南也有散在病例，在北方相对比较少见。