甲状腺消融术是治疗甲状腺良性结节的一种很好的手段，创伤较小，但也会出现一定副作用，具体如下：

1、穿刺损伤：最常见是在甲状腺结节穿刺过程中出现穿刺损伤，甲状腺是颈部很重要的器官，颈部周围分布着非常丰富的血管、神经、肌肉、气管、食管及其他重要组织，在穿刺过程中可能会损伤到重要的组织和器官。但是在临床中因为有超声引导，医生会看得非常清楚，这种损伤的发生率很低；

2、热损伤：消融术的治疗机制是对甲状腺结节进行微波消融，在结节消融过程中会引起热损伤。临床针对热损伤有防护措施，包括给予液体隔离等。