目前鼻息肉手术通常在鼻窦内窥镜下进行，由于需经过鼻腔途径，在手术过程中痛苦比较明显。为减少痛苦，通常在全麻下进行手术，部分医院可能通过局麻进行比较简单的手术，但痛苦均在可接受范围。

全麻后手术因为在麻醉状态，患者无知觉，送回病房完全清醒时，鼻腔可能处于填塞状态。一般填塞需经过48个小时，在此期间填塞所引起的鼻腔内不通气以及胀痛感，大于手术本身引起的疼痛感。所以多数患者自觉进行鼻息肉手术后，不能接受填塞物带来的异常感觉。