脸上起小疙瘩通常要根据疾病的种类、疾病原因进行对症治疗和处理，具体如下：

1、扁平疣，通常是由人乳头状瘤病毒感染引起，在临床上常见的脸上会出现与肤色相同的扁平的、小的丘疹。对于扁平疣的治疗，一般通常采用吃药、抹药的方法杀死病毒，保证不再起新的，大的变小，小的慢慢消失，以达到根治的目的；

2、粉刺，学名是早期痤疮，是由于青春期油脂分泌旺盛，油脂分泌多，堵塞毛孔形成，这种情况采用维A酸类药物治疗也可以，同时可采用激光或者果酸换肤、水杨酸换肤等治疗方法收缩毛孔。