黄鼻涕一般常见于鼻窦炎，而清鼻涕一般见于急性鼻炎或者过敏性鼻炎，这是两者的主要区别。黄鼻涕一般说明很可能有细菌感染，尤其在黄鼻涕持续超过7-10天，仍然不缓解的情况下要考虑细菌感染的可能性。必要时要使用抗生素治疗，比如阿莫西林克拉维酸钾。

对于急性鼻窦炎需要治疗10天，对于慢性鼻窦炎，需要连续使用至少3周，而清鼻涕多数见于急性鼻炎，比如感冒。这个情况一般来说，不需要特别用药治疗，通常会在1周左右，逐渐缓解和自愈。

过敏性鼻炎通常也是清水样鼻涕，另外通常还伴有鼻痒，打喷嚏、鼻塞，嗅觉下降等相关症状。过敏性鼻炎的治疗，通常可以用鼻腔生理性海水，做鼻腔冲洗每天1-2次，冲洗后间隔15分钟，用鼻喷激素喷鼻。比如糠酸莫米松或者氟替卡松、布地奈德等。

一般连续用2周就可以达到相对好的效果，连续用1-3个月就可以达到相对稳定，持续的缓解效果。必要时还可以再加用鼻喷的抗组胺药，比如氮卓斯汀或者是左卡巴斯汀，还可以加口服的抗组胺药，如氯雷他定，以及必要时还可以再加口服的白三烯受体拮抗剂，比如孟鲁司特。