膀胱结石最佳的确诊方法是膀胱镜，因为膀胱镜是内窥镜，通过尿道进入膀胱，可以直接观察膀胱内的情况。如果是结石，肉眼可以直接看见，是最可靠的确认方法，B超、CT、X光片等是比较常用的无创性检查方法。

膀胱镜属于有创检查，患者做膀胱镜时需在尿道使用局麻药物，膀胱镜进入后可能会损伤尿道黏膜等。虽然膀胱镜是最佳的确诊方法，但不是比较常用的方法，因为通过CT、B超等检查，也完全可以诊断膀胱结石。