腋毛癣由纤细棒状杆菌感染腋毛毛干引起，虽然称为癣但其实并非真菌感染引起，而是细菌感染，所以治疗主要使用抗菌素杀灭细菌药物，而且一般只需局部外用抗菌药即可。常用药物比如过氧苯甲酰凝胶、克林霉素乳膏、夫西地酸乳膏、红霉素软膏，对于引起腋毛癣的纤细棒状杆菌比较有效，可以有效杀灭纤细棒状杆菌，从而治愈腋毛癣。

以前用硫磺软膏、氯霉素搽剂、稀甲醛溶液，有杀菌、止汗作用，也有一定效果。腋毛癣除用抗菌药物治疗外，需要注意局部清洁卫生，避免局部潮湿多汗，保持局部干爽，腋毛癣才能够有效被控制，不易复发。