川崎病有一定比例的复发，且不完全川崎病的复发比例，高于完全性川崎病。川崎病复发后需再次应用丙种球蛋白，甚至可能应用激素、免疫抑制剂等特殊药物。

复发的川崎病冠状动脉病变的发生率，比不复发的川崎病冠状动脉病变发生率明显提升。在复发时，通常有一定危险因素，如婴幼儿、男性、有家族史或兄弟姐妹有川崎病，则会有一定复发比率。但总体而言，川崎病的复发比率较低，即使是川崎病复发，家长也不需要惊慌、焦虑，医生会有一定评估。主要关注炎症反应，复发后孩子的炎症反应较重时，可相应地给予治疗。