卵巢位于子宫两侧，如果是卵巢旁囊肿，常考虑为系膜囊肿，包括输卵管积水、子宫浆膜下肌瘤。所谓囊肿包括液性、囊性，小囊肿通常不影响输卵管排卵，不影响怀孕。但较大囊肿则可能会改变输卵管与卵巢之间关系，从而会影响输卵管拾卵、排卵。

如果单侧卵巢出现囊肿，另一侧卵巢同样能够完成排卵、拾卵过程，通常并不影响患者生育。但是如果两侧均存在较大囊肿，则可能会影响排卵、拾卵，从而影响怀孕。还有部分囊肿是因为子宫内膜异位，导致卵巢本身出现囊肿，此时则也会影响患者生育。如果卵巢没有受到影响，输卵管也没有受到影响，通常不会影响生育。