口腔溃疡可以选用漱口水漱口，漱口水种类较多，应选用对口腔溃疡有促进愈合作用的漱口水，比如康复新液、西帕依固龈液等。患者也选用存在消炎作用的漱口水，如洗必泰漱口水。
口腔溃疡时，主张选用有消炎、止疼、促进溃疡愈合的药物和漱口水，特别是对于疱疹样阿弗他溃疡，溃疡发生时数量较多，一般只能应用漱口水治疗。但不应选择日用漱口水，比如去牙石或清新口气的漱口水，部分漱口水中含有薄荷成分，会刺激口腔黏膜并引起疼痛。同时部分漱口水中含有酒精，应避免在溃疡发生时使用。而对于含有中草药且标明治疗复发性口腔溃疡的漱口水，一般推荐使用。
