角膜屈光手的禁忌症也很多，主要有2大类：
1、眼部的禁忌症：首先要排除角膜过薄或者角膜形态不好。有的人角膜太薄了，比如低于480μm，或者角膜太凸、太平，或者角膜有圆锥角膜的倾向，这些都不能做手术。另外眼部的炎症，包括睑缘炎、角膜炎，还有其它炎症，首先要控制炎症，尤其是睑缘炎，治疗好以后以避免角膜做完手术以后，影响角膜的恢复。如果病毒引起的角膜炎，尽量不要做手术，即使平稳后，会有局部的瘢痕，容易复发，也尽量不要做手术。另外，有一些人有严重的葡萄膜炎，定期反复发作，或者是有青光眼，或者是有眼底问题，比如网脱等这些情况都不能做手术；
2、全身病的禁忌症：全身的禁忌症包括有严重瘢痕体质，或者是免疫性疾病，系统性红斑狼疮，有严重糖尿病，严重的甲亢等全身病，有这些全身病也不太适合做角膜屈光手术。