肠镜下发现溃疡必须做活检。因为常见的溃疡性结肠炎、克罗恩病、慢性结肠炎有时候也有溃疡的表现，这时候做活检可以指导治疗。

溃疡也可能是癌变的表现，这时候最好做肠镜取病理，看究竟是炎症的表现还是癌症的表现，因为明确是哪种表现以后，才能根据病理进一步治疗。假如是炎症，可能口服药物调节肠道菌群就能改善。但如果是溃疡癌变，要尽早、及时做手术及其它药物治疗。