系统性红斑狼疮确切发病机制目前尚不明确，所以临床上难以做到完全预防。现有研究表明，系统性红斑狼疮是一种遗传易感性的多因素疾病，一些患者可能是由于感染、环境、情绪等因素，诱导发病。长期日晒、药物也可以诱发狼疮，例如常用的青霉素，还有一些避孕类药物。
系统性红斑狼疮患者的一级亲属，患病率较其他人群有增高趋势，应当提高警惕。